Zur medikamentösen Therapie der Endometriose zählt der Einsatz von Schmerzmitteln, wodurch kurzfristig Schmerzfreiheit erreicht werden kann. Eine Behandlung der Ursache erfolgt damit jedoch nicht. Hierzu werden Hormone eingesetzt. Es kommen sehr unterschiedliche Substanzen zur Anwendung, aber alle unterbrechen mehr oder weniger den Menstruationszyklus und die Eireifung, so dass in der Gebärmutter keine Schleimhaut mehr aufgebaut wird.
Damit werden auch die Endometrioseherde ruhig gestellt und bilden sich häufig sogar zurück. Ein Kriterium für die Wahl des Präparates sollte stets die Berücksichtigung der Nebenwirkungen sein, da diese zum Teil nicht unerheblich sind. Die alleinige Hormontherapie wird eher bei leichten, wenig ausgeprägten Endometriosen eingesetzt, mit dem Nachteil, dass es relativ häufig nach dem Absetzen der Hormone zum Widerauftreten von Endometrioseherden kommt.
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